Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMA5O15230 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms