Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSDA5PKW4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms