Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms