Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms