Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms