Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms