Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms