Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms