Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms