Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-6Q9BXR3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms