Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms