Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPIN3Q9BQK8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms