Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TCF12Q99081 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TCF12Q99081 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms