Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF4Q8WXU2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms