Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD1Q8NHV4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms