Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms