Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKBIPQ70UQ0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms