Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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