Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms