Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3EQ6PEY2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms