Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WSCD1Q658N2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms