Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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C9orf135Q5VTT2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C9orf135Q5VTT2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C9orf135Q5VTT2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf135Q5VTT2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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