Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PRAMEF20Q5VT98 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PRAMEF20Q5VT98 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PRAMEF20Q5VT98 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PRAMEF20Q5VT98 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PRAMEF20Q5VT98 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PRAMEF20Q5VT98 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PRAMEF20Q5VT98 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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