Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNPY1Q3B7I2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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