Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms