Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CCDC96Q2M329 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CCDC96Q2M329 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CCDC96Q2M329 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CCDC96Q2M329 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CCDC96Q2M329 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CCDC96Q2M329 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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CCDC96Q2M329 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC96Q2M329 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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