Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms