Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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