Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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