Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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UBE3CQ15386 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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UBE3CQ15386 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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UBE3CQ15386 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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UBE3CQ15386 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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UBE3CQ15386 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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UBE3CQ15386 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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