Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EEA1Q15075 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC27.53■■■□□ 2
EEA1Q15075 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EEA1Q15075 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EEA1Q15075 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EEA1Q15075 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EEA1Q15075 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
EEA1Q15075 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EEA1Q15075 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EEA1Q15075 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.52■■■□□ 2
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EEA1Q15075 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EEA1Q15075 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EEA1Q15075 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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EEA1Q15075 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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EEA1Q15075 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EEA1Q15075 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
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EEA1Q15075 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
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EEA1Q15075 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
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EEA1Q15075 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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EEA1Q15075 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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EEA1Q15075 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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EEA1Q15075 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EEA1Q15075 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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