Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms