Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CLCA4Q14CN2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CLCA4Q14CN2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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CLCA4Q14CN2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CLCA4Q14CN2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CLCA4Q14CN2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CLCA4Q14CN2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CLCA4Q14CN2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCA4Q14CN2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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