Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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