Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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