Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1H3Q13133 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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