Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FOXC1Q12948 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FOXC1Q12948 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FOXC1Q12948 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FOXC1Q12948 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FOXC1Q12948 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FOXC1Q12948 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FOXC1Q12948 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FOXC1Q12948 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FOXC1Q12948 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FOXC1Q12948 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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