Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms