Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOX4Q06945 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms