Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBQ06643 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms