Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms