Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC10Q01780 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC10Q01780 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms