Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms