Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms