Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms