Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms