Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms