Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX2P50458 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX2P50458 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX2P50458 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX2P50458 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX2P50458 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms