Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTPAP49638 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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