Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ME1P48163 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ME1P48163 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ME1P48163 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ME1P48163 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ME1P48163 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ME1P48163 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ME1P48163 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ME1P48163 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ME1P48163 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ME1P48163 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms